ต่อมาปี ๒๕๑๒ - ๒๕๑๗ ครูบาเจ้าชัยยะวงศาพัฒนาได้มาบูรณะปฏิสังขรณ์ โดยได้สรา้งวิหารไว้และก่อสร้างสถูปเจดีย์ (กู่) ๓ องค์ เพื่อบรรจุอัฐิธาตุ ของครูบาเจ้าชัยยะลังกา , ครูบาเจ้าอินถา, ครูบาเจ้าศรีวิชัย
ปี พ.ศ. ๒๕๑๖ - ๒๕๑๘ พระสิงห์แก้ว อินฺทวโร (เนียมพรมลี) ได้มาบูรณะปฏิสังขรณ์ดูแลวัดต่อครูบาเจ้าชัยยะวงศาพัฒนา เมื่อพระสิงห์แก้ว กลับไปจังหวัดลำพูน วัดดอยกู่ ก็ไม่มีพระภิกษุอยู่จำพรรษา จึงเป็นวัดร้างอีกครั้ง
พอปี พ.ศ. ๒๕๓๘ สภาตำบลป่าซางได้ยกให้วัดดอยกู่ เป็นวัดประจำตำบลป่าซาง และชาวตำบลป่าซาง ได้จัดงานประเพณีสรงน้ำ พระธาตุกู่ครูบาในวันวิสาขบูชา (แปดเป็ง) ของทุกๆปี
ใน ๖ กุมภาพันธ์ พ.ศ. ๒๕๔๕ คณะศรัทธาชาวบ้านก็ได้นิมนต์ พระกมล สิริธมฺโม (สุริคำ) มาทำการบูรณะปฏิสังขรณ์ พร้อมทั้งสร้างวัดให้ถูกต้องตามกฏหมาย โดยทำการยกเลิก หนังสือสำคัญสำหรับที่หลวง (นสล.)และได้ขอยกวัดร้างให้เป็นวัดโดยมีพระภิกษุอยู่จำพรรษา ต่อมา สำนักงานพระพุทธศาสนาแห่งชาติ (พศ.) ได้ทำการยกวัดดอยกู่ (วัดร้าง) ให้เป็นวัดที่ถูกต้องตามกฏหมาย เมื่อวันที่ ๑๙ ตุลาคม พ.ศ. ๒๕๕๑ และได้ร่วมกับคณะศรัทธาสาธุชน ทำการพัฒนาวัดมาจนถึงปัจจุบัน
*******************************************************************